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[導(dǎo)讀] 以美國(guó)佛蒙特大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)系教授舒亞·邦加德為通訊作者的研究團(tuán)隊(duì),日前在《美國(guó)科學(xué)院院報(bào)》在線發(fā)表一篇最新研究結(jié)果,提出可創(chuàng)建一種可編程生物,被命名為Xenobot(異形機(jī)器人),也可稱為生物機(jī)

以美國(guó)佛蒙特大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)系教授舒亞·邦加德為通訊作者的研究團(tuán)隊(duì),日前在《美國(guó)科學(xué)院院報(bào)》在線發(fā)表一篇最新研究結(jié)果,提出可創(chuàng)建一種可編程生物,被命名為Xenobot(異形機(jī)器人),也可稱為生物機(jī)器人。

邦加德等人的研究發(fā)表后,引發(fā)了很多質(zhì)疑。那么,他們的工作到底是做什么呢?

1.Xenobot是怎么造出來(lái)的?

邦加德對(duì)這種人造生命做了定義:“它們既不是傳統(tǒng)的機(jī)器人,也不是已知的動(dòng)物物種。這是一種活的、可編程的有機(jī)體?!?/p>

不是傳統(tǒng)的機(jī)器人,即不是機(jī)械裝置的機(jī)器人,而是不到1毫米的生物機(jī)器人,即微型生物機(jī)器人,比微生物大得多,也比一些寄生蟲(chóng)大。只不過(guò),它是人造的。其他的微生物,如細(xì)菌、病毒、衣原體、支原體等,還有動(dòng)植物和人,都是地球上自然演化和存在的生物。

Xenobot的合成首先是獲取了非洲爪蛙的心臟細(xì)胞和表皮細(xì)胞兩種細(xì)胞,但都是從爪蛙胚胎干細(xì)胞中分化獲取的。

研究人員在顯微鏡下先將胚胎細(xì)胞切開(kāi),細(xì)胞被切開(kāi)的兩個(gè)部分,單獨(dú)進(jìn)行培養(yǎng)。而后將兩種細(xì)胞拼湊在一起,采用的是細(xì)胞的自然傾斜度相互黏附方式。研究人員再觀察它們獨(dú)特的結(jié)構(gòu)(包括細(xì)胞排列和斑點(diǎn)的整體形狀)如何與行為對(duì)應(yīng)。

將相關(guān)數(shù)據(jù)發(fā)送給佛蒙特大學(xué)的計(jì)算機(jī)科學(xué)家團(tuán)隊(duì),后者利用超級(jí)計(jì)算機(jī)集群Deep Green對(duì)異形機(jī)器人的數(shù)字化版本構(gòu)建了一個(gè)模擬環(huán)境,并且利用了生命演化的自然選擇的過(guò)程。根據(jù)這個(gè)模型,在模擬中完成特定任務(wù)的Xenobot被認(rèn)為是“合適的”,從而創(chuàng)造出新一代“進(jìn)化的”Xenobot。研究人員還按照超級(jí)計(jì)算機(jī)模擬出來(lái)的設(shè)計(jì),用鑷子和電極對(duì)這個(gè)重塑的細(xì)胞進(jìn)行“雕琢”。重塑的細(xì)胞形狀各異,有的是楔形,有的是拱形。

由于Xenobot是由非洲爪蛙心臟細(xì)胞(收縮細(xì)胞)和表皮細(xì)胞(被動(dòng)細(xì)胞)結(jié)合而成,因而具有自然生命的多種生命特質(zhì),如可以在水性介質(zhì)中移動(dòng)、具有自我修復(fù)能力、可自行生物降解。最厲害的是,即便把生物機(jī)器人切成兩半,它不僅能把自己縫合起來(lái),還能繼續(xù)活動(dòng),有點(diǎn)兒像蠑螈的自我修復(fù)功能。而且,它們不只能直線行進(jìn),也能轉(zhuǎn)圈。如果把這個(gè)機(jī)器人翻轉(zhuǎn)過(guò)來(lái),它就像烏龜背朝下一樣,失去了移動(dòng)能力。

目前,這種生物機(jī)器人可以用來(lái)清理海洋中的微塑料污染,作為可生物降解的藥物輸送機(jī)器人等,而且,未來(lái)的作用也將是無(wú)限的,例如,作為手術(shù)助手疏通血管等。

2.世界上已有多個(gè)人造活體生命

不過(guò),Xenobot并非世界上第一個(gè)人造的活體生命,此前早就有純粹生物合成的人造生命問(wèn)世了。

早在1995年,美國(guó)的克雷格·文特爾就和另一位生物學(xué)家漢密爾頓·史密斯造出了首個(gè)有人造基因組(染色體組)的細(xì)菌,這是一種不依靠上一代繁衍的存活生物,也是人造生命的雛形。

2010年5月20日,文特爾私立研究所的一個(gè)由46名科學(xué)家組成的團(tuán)隊(duì)又研發(fā)出了地球上首例人造細(xì)胞,是一個(gè)山羊支原體細(xì)胞,細(xì)胞中的遺傳物質(zhì)是依照另一個(gè)物種蕈狀支原體的基因組人工合成的,產(chǎn)生的人造細(xì)胞表現(xiàn)出的是后者的生命特性,取名為辛西婭(Synthia,意為“合成體”)。

辛西婭這種微生物由藍(lán)色細(xì)胞組成,能夠生長(zhǎng)、繁殖,細(xì)胞分裂了逾10億次,能產(chǎn)生一代又一代的人造生命。植入的DNA片段包含約850個(gè)基因,而人類基因組共有約2萬(wàn)個(gè)基因。

研究員建構(gòu)的染色體中的基因,由108萬(wàn)對(duì)“字母”組成,并在合成基因留下“水印”,包括46名科學(xué)家和研究員的名字、研究所的網(wǎng)址,以及愛(ài)爾蘭作家詹姆斯·喬伊斯的名句“生存、犯錯(cuò)、倒下、戰(zhàn)勝,用生命創(chuàng)造生命”。2010年5月21日出版的《科學(xué)》雜志發(fā)表了這一研究。

文特爾等人選取一種名為絲狀支原體的細(xì)菌,將它的染色體解碼。然后利用化學(xué)方法一點(diǎn)一點(diǎn)地重新排列DNA。此后將重組的DNA碎片放入酵母液中,令其慢慢地重新聚合。再把人造DNA放入另外一個(gè)受體細(xì)菌中。通過(guò)生長(zhǎng)和分離,受體細(xì)菌產(chǎn)生兩個(gè)細(xì)胞,一個(gè)帶有人造DNA,另外一個(gè)帶有天然DNA。在培養(yǎng)皿中加入抗生素,把帶有天然DNA的細(xì)胞殺死,只留下人造DNA不斷增生。幾個(gè)小時(shí)之內(nèi),受體細(xì)菌內(nèi)原有DNA的所有痕跡全部消失,人造細(xì)胞不斷繁殖,新的生命誕生。

合成這樣的人造生命有什么用呢?文特爾的回答是,先合成出可供生命存在的最小數(shù)量的基因,然后通過(guò)向其中彌補(bǔ)其他基因,制造一系列新的微生物,如可生產(chǎn)生物燃料的細(xì)菌、有用的藥品、可以從空氣中吸收二氧化碳和其他污染物的細(xì)菌或是制造合成疫苗所需的蛋白質(zhì)。

此后,2018年8月2日,英國(guó)《自然》同時(shí)在線發(fā)表了美國(guó)和中國(guó)研究人員的2篇論文,都是將酵母染色體融合的成果。中國(guó)的研究人員創(chuàng)造了一種新的人工合成的酵母,僅含1條巨大的線型染色體酵母SY14菌株,不同于野生型的有16條染色體的酵母。

此次人工合成的酵母是真核生物。動(dòng)物、植物、真菌等都屬于真核生物,其基因組既豐富又復(fù)雜,通常會(huì)包含數(shù)億至數(shù)十億堿基對(duì)信息,合成并不容易。但細(xì)菌、病毒等原核生物的基因組相對(duì)簡(jiǎn)單,合成比較容易。因此,合成真核生物基因組在技術(shù)是上了一個(gè)臺(tái)階,有更大的作用。

釀酒酵母是第一個(gè)被全基因組測(cè)序的真核生物,大尺度的設(shè)計(jì)和重建酵母基因組是對(duì)目前酵母領(lǐng)域知識(shí)貯備的真實(shí)性、完整性和準(zhǔn)確性的一個(gè)直接考驗(yàn)。人工合成酵母,一方面可以幫助人類更深刻地理解一些基礎(chǔ)生物學(xué)的問(wèn)題,另一方面可以通過(guò)基因組重排系統(tǒng),使酵母實(shí)現(xiàn)快速進(jìn)化,獲得在醫(yī)藥、能源、環(huán)境、農(nóng)業(yè)、工業(yè)等領(lǐng)域有重要應(yīng)用潛力的菌株。

3.合成人造生物的利弊

此次的Xenobot和之前的辛西婭、人造酵母都是人工合成的活體生命,只不過(guò)辛西婭較簡(jiǎn)單一些,是依據(jù)原核生物合成的,而人造酵母是合成真核生物。Xenobot也是利用真核生物模型合成,而且動(dòng)用了生命演化模式和計(jì)算機(jī)編程功能結(jié)合合成。Xenobot的體積比過(guò)去創(chuàng)造的人造生命大了很多,接近1毫米,而支原體只有0.1-0.3微米,酵母則有2-10微米,因此,Xenobot能完成的工作和功能也會(huì)遠(yuǎn)遠(yuǎn)多于支原體和酵母。

但是,它們是否會(huì)對(duì)人類社會(huì)造成威脅,成為生物武器呢?這可能是人們感到恐懼的原因。早在2010年文特爾等創(chuàng)造出辛西婭時(shí),美國(guó)就進(jìn)行過(guò)多個(gè)領(lǐng)域和部門(mén)的聽(tīng)證會(huì),要求文特爾等人全面解釋人造生命的正反兩方面意義和應(yīng)用。聽(tīng)證會(huì)對(duì)合成新生命提出了13個(gè)方面的問(wèn)題,其中包括為什么要合成人造細(xì)胞(生命);人造生命的潛在用途是什么;合成生物的風(fēng)險(xiǎn)有哪些;有什么準(zhǔn)備好的保護(hù)、控制措施以防止人工生命偶然地向環(huán)境釋放等。

針對(duì)人工合成新生命的安全問(wèn)題,文特爾等人表示,合成生物學(xué)與很多基因組技術(shù)一樣,既能產(chǎn)生有益的生物工程微生物,也有可能創(chuàng)造對(duì)人類及環(huán)境有害的微生物,這類技術(shù)當(dāng)然可能被擁有廣泛資源的邪惡者所利用。

不過(guò),自然本身就是一名已經(jīng)存在的專家,它也在創(chuàng)造可對(duì)人類造成極大危害的微生物。人工合成新生命并不一定會(huì)把人類帶到比現(xiàn)有技術(shù)或自然本身更接近傷害的道路。對(duì)此,需要的是嚴(yán)格管理。

實(shí)際上,現(xiàn)在的Xenobot被設(shè)計(jì)出來(lái)后,既可以看到其有巨大的用途,也應(yīng)看到在應(yīng)用當(dāng)中可能對(duì)人和自然環(huán)境產(chǎn)生危害,關(guān)鍵是需要立法管理,以保證在應(yīng)用Xenobot時(shí),必須有配套的法規(guī)約束。

生命的多種形式

人造生命與自然生命最大的區(qū)別在于,前者是“如其所能的生命”(life as it could be),而后者則是“如吾所識(shí)的生命”(life as we know it)。如吾所識(shí)的生命就是今天人們已經(jīng)認(rèn)識(shí)的各種動(dòng)物、植物和微生物;如其所能的生命包括可能存在于其他星球但尚未被發(fā)現(xiàn),以及人類創(chuàng)造出來(lái)的數(shù)字生命、虛擬生命和人造生命(物)。

美國(guó)著名科學(xué)作家、生物化學(xué)家阿莫西夫?qū)ψ匀簧袔追N劃分。一是以氟化硅酮為介質(zhì)的氟化硅酮生物;二是以硫?yàn)榻橘|(zhì)的氟化硫生物;三是以水為介質(zhì)的核酸/蛋白質(zhì)(以氧為基礎(chǔ)的)生物;四是以氨為介質(zhì)的核酸/蛋白質(zhì)(以氮為基礎(chǔ)的)生物;五是以甲烷為介質(zhì)的類脂化合物生物;六是以氫為介質(zhì)的類脂化合物生物。

盡管現(xiàn)在美國(guó)科學(xué)家創(chuàng)造的Xenobot是微型生物機(jī)器人,但其大部分是根據(jù)第四種自然生命的原則來(lái)創(chuàng)造的,即以氨為介質(zhì)的核酸/蛋白質(zhì)(以氮為基礎(chǔ)的)生命。所以它與自然生命有相似之處。

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